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在进行三代试管的治疗中，很可能出现胚胎染色体异常的情况，而这种胚胎一般会被淘汰。导致胚胎染色体变异的原因有很多，其一可能是精子卵子本身就存在染色体异常情况，其二污染导致导致胚胎在进行减数分裂的过程中出现错误，其三医生授精过程中对胚胎造成的伤害。
精卵质量差会导致胚胎染色体异常
在进行试管的治疗中，精子卵子相遇形成胚胎是最关键的步骤，如果没有胚胎就不能进行移植，因此不管医生还是患者对胚胎的培养都格外看中。但是试管的治疗很难一帆风顺，胚胎出问题的几率的是比较大的，一旦胚胎出现染色体异常，就要重新培养。
人工授精也会导致染色体异常
三代试管婴儿胚胎出现染色体异常与很多因素有关，其中环境污染是罪魁祸首之一，下面是具体的分析。
胚胎染色体与试管年龄的关系
患者进行试管治疗的年龄也会影响试管胚胎染色体的异常率，一般来说，试管患者的年纪越大胚胎染色体异常率就会越高。有相关研究表明，40岁进行试管治疗的患者，其胚胎染色体异常的几率在58%左右；而45岁进行试管治疗，胚胎染色体异常概率高达84%。
年纪越大胚胎染色体异常率越高
由于三代试管会进行胚胎健康诊断，因此染色体异常的胚胎会被直接淘汰，只是三代试管相比一代、二代试管的绝对优势。正是由于三代试管筛选胚胎的特点，对于患有家族遗传病的患者来说，也可以进行三代试管的治疗。
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